Призначаються препарати «Фансидар», «Роваміцин» та «Бісептол». Фансидар містить сульфадоксин 500 мг та піриметамін 25 мг. Етіотропна терапія складається з 2-3 циклів.
Як правило, хворому призначають протипаразитарні лікарські препарати – найчастіше хлоридин, який комбінується із сульфаніламідними засобами, що посилюють його дію. При вагітності часто призначають спіраміцин.
Повністю позбутися від цист токсоплазми майже неможливе, тому лікування спрямоване на зміцнення імунітету. Пацієнти, у яких яскраво виражені симптоми, потребують тривалого лікування, застосування хіміотерапевтичних препаратів та антибіотиків.