Біфідумбактерин приймають під час їди, при необхідності незалежно від їди. Препарат перед вживанням змішують з рідкою їжею, бажано кисломолочним продуктом, новонародженим та дітям грудного віку – з материнським молоком або сумішшю для штучного вигодовування.
Терапевтичний ефект біфідумбактеріну визначають живі біфідобактерії, що містяться в ньому, які володіють антагоністичною активністю проти широкого спектра патогенних і умовно-патогенних мікроорганізмів і тим самим нормалізують кишкову і вагінальну мікрофлору.
Біфідумбактерін, ліофілізат для приготування розчину для прийому внутрішньо та місцевого застосування, призначений для лікування гострих та хронічних захворювань шлунково-кишкового тракту, що супроводжуються дисбактеріозом у дітей та дорослих. Дітям (у тому числі недоношеним) препарат можна застосовувати з перших днів життя.
Необхідну кількість доз (відповідно чайних ложок) приймати за 20-30 хв. до їжі. Грудним дітям препарат можна давати безпосередньо перед годуванням.