Можливі загальмованість, м'язова слабкість, сонливість, зниження працездатності, тривале застосування — запор. В окремих випадках можливий розвиток алергічних реакцій.
Крім іншого дослідження показують, що тривалий прийом валеріанки призводить до підвищення артеріального тиску, частим головним болям, появі безпричинного відчуття тривоги, проблем зі сном.
Кому не можна пити валеріанку вагітним; жінкам, які годують грудьми, тому що весь ефект піде і до дитини; при гіпертонії; при хронічному ентероколіті – одночасному запаленні тонкої та товстої кишки.
Валеріана має седативну, транквілізуючу дію на центральну нервову систему. Вважається ефективним природним засобом при лікуванні депресії, безсоння, нервозності, тривожному стані та інших неврологічних проблем.